Os anticorpos antineuronais foram descritos em pacientes com Lúpus eritematoso sistêmico. Alguns anticorpos antineuronais podem ser gerados a partir de antígenos neuronais liberados no tecido cerebral. Normalmente a barreira hematoencefálica previne o contato direto dos anticorpos antineuronais com o tecido cortical, mas esta barreira pode ser lesada nos locais de microinfartos, permitindo o influxo dos anticorpos séricos. Um mecanismo adicional seria a facilitação do transporte de imunoglobulinas séricas para o líquor devido à presença de isquemia, sem infarto, e dos níveis aumentados de serotonina dos trombos plaquetários.
Este exame é indicado para auxiliar a avaliação de encefalopatia de início súbito de causa não infecciosa ou metabólica, com uma ou mais das seguintes manifestações: estados de confusão mental, psicose, delírio, perda de memória, alucinações, distúrbios do movimento, convulsões e hipoventilação. A Encefalite anti-NMDA é uma forma altamente letal, mas tratável de encefalite auto-imune. É encontrada mais frequentemente em mulheres jovens e associada a teratoma ovariano. O diagnóstico é raro e deve ser considerado em mulheres jovens com quadro clínico de encefalite de início rápido sem outra causa aparente (principalmente quando encefalite por herpes é descartada).