O teste é essencial na investigação de imunodeficiências associadas a alterações nos linfócitos T auxiliares, como na AIDS, onde o vírus HIV ataca seletivamente as células CD4 positivas. Isso resulta em uma redução progressiva no número dessas células e na diminuição do índice CD4/CD8. A quantificação absoluta e percentual dos linfócitos CD4 é fundamental para avaliar o estado imunológico do paciente e orientar o acompanhamento terapêutico.