Este exame é utilizado para o diagnóstico de febre amarela, doença grave, de alta letalidade, causada pelo vírus da febre amarela. A doença é endêmica no Brasil, mas se comporta com ondas epidêmicas periódicas. O exame é importante ainda para diagnóstico diferencial das várias arboviroses que circulam concomitantemente no Brasil atualmente: dengue, zika, chikungunya, febre amarela, mayaro, oropouche e vírus do nilo ocidental. Em pacientes com febre amarela, a viremia pode ser detectada por 5 a 10 dias após o início dos sintomas, enquanto a produção de anticorpos se inicia a partir do quinto dia. Na primeira semana de doença, portanto, o teste recomendado para o diagnóstico é a PCR, enquanto a pesquisa de anticorpos é útil a partir da segunda semana. Este teste detecta uma região conservada do RNA do vírus da febre amarela, logo, não é capaz de distinguir o vírus selvagem do vacinal. Desse modo, pessoas vacinadas contra febre amarela até 30 dias antes da coleta da amostra podem apresentar resultado detectado (positivo).