O peptídeo C é utilizado para avaliar a produção de insulina pelo corpo (endógena), diferenciando-a da insulina injetada como medicamento (exógena), que não gera peptídeo C. Níveis altos de peptídeo C  são encontrados na diabetes tipo 2, insulinomas, hipocalemia, gravidez, síndrome de Cushing e insuficiência renal.  Níveis baixos estão associados a baixa produção de insulina. Isso pode ser observado na diabetes tipo 1 e insulinoterapia.Em indivíduos não diabéticos, a resposta do peptídeo C após a ingestão da glicose é superior ao seu valor basal em 300 a 400% aos 30 minutos, e em 250 a 300% aos 60 minutos.
Por se tratar de um teste menos invasivo que o de estímulo com glucagón, as dosagens seriadas de peptídeo C e glicose após estímulo com  glicose, pode-se constituir no exame de escolha para a determinação da função das células beta.