Os anticorpos anti-mitocondria (AMA) são detectados primeiramente em paciente com cirrose biliar primária pelo método da imunofluorescência indireta. Existem 9 tipos de AMA (M1 ao M9), entretanto os mais pesquisados são o tipo M1 e M2. O antígeno do tipo M1 está relacionado a doenças como sífilis, lúpus eritematoso sistêmico, esclerose sistêmica, artrite reumatoide, trombose, síndrome de Sjogren's e a perda fetal. O antígeno do tipo M2 está relacionado às doenças hepáticas como cirrose biliar primária, outras hepatites crônica e em poucos casos esclerose múltipla.

* Devido às limitações da técnica, em alguns casos não é possível oferecer um resultado conclusivo devido à presença de imunofluorescência positiva inespecífica.